La noche del 13 de noviembre se registraron nuevos incidentes en la Penitenciaría del Litoral, con reportes de disparos provenientes del interior del centro cerca de las 19:00, según relataron moradores de la zona. De inmediato, policías y militares se desplazaron al lugar. Aunque el Servicio de Atención a Personas Privadas de la Libertad no emitió un comunicado oficial, la información preliminar indica que los disturbios involucraron a internos de los pabellones 3 y 10, con presunta transferencia de reos a través del llamado «callejón de la muerte», quienes ya fueron detenidos.

Este nuevo episodio de violencia ocurre apenas un día después de la masacre del 12 de noviembre, que dejó 17 reos muertos y 15 heridos en el mismo centro penitenciario. Por esta tragedia, un juez de Guayaquil dictó prisión preventiva para nueve internos, quienes serán investigados por su presunta participación en los hechos, aunque ya cumplían condenas por otros delitos.